我的房子是八年前盖的。邻居们说出了界限，并通过村委会的调解达成了协议。

针对您提出的问题，如果邻居在墙上打孔的行为确实违反了你们之前通过村委会调解达成的协议，您完全有权依据该协议内容起诉他。根据《中华人民共和国人民调解法》第三十一条的规定，经人民调解委员会调解达成的调解协议，具有法律约束力，当事人应当按照约定履行。因此，如果邻居不履行协议，您可以通过法律途径维护自己的权益，包括但不限于向法院提起诉讼。在诉讼过程中，您需要提供充分的证据证明邻居的违约行为以及协议的有效性。
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从法律角度，为应对可能发生的诉讼，您应准备以下证据：1、收集并保留与邻居达成的调解协议原件或复印件，以证明双方曾就界限问题达成协议；2、拍摄邻居在墙上打孔的照片或视频，以证明其违约行为；3、如有必要，可邀请证人出庭作证，证明邻居的违约行为及对您造成的影响。确保所有证据真实、合法、有效，以便在诉讼中充分发挥其作用。
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除了起诉外，您还可以尝试以下途径解决邻居打孔的问题：1、再次与邻居协商，明确表达您的立场和诉求，看是否能达成和解；2、请村委会或居委会再次介入调解，利用他们的权威性和公信力促使双方和解；3、如果邻居的行为涉嫌破坏您的财产，您可以报警处理，让警方根据具体情况采取相应措施。